A finales de 1999 Go Nagai decidió recontar la historia de Mazinger añadiendo elementos de la mitología griega y aportándoles una estética más acorde a los nuevos tiempos.
Aquí vemos como en la antigua Grecia, los dioses griegos eran en realidad gigantescos robots venidos del espacio exterior.
En la época actual, Hades (Dr. Inferno) ha vuelto para conquistar la tierra y exterminar la raza humana. Para protegernos Zeus envía a su robot
Z-Mazinger que cae en manos del joven estudiante Koji Kabuto.